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基因注释是连接“测出基因组”和“读懂基因组”的核心环节，是基因组研究走向功能解析和应用转化的重要基础。随着国际大型基因组计划持续产出海量数据，如何实现高质量基因注释已成为后基因组时代亟待突破的重要瓶颈。传统方法通常依赖RNA测序、同源蛋白等外部证据，存在数据需求高、计算开销大、对数据匮乏物种适用性受限等问题。